Category: наука

Category was added automatically. Read all entries about "наука".

«Навигатор» блога

Мой блог это набор научно-популярных текстов, посвящённых проблемам пола, гендера и сексуальной ориентации. В постах нет элемента злободневности. Их можно читать выборочно, в зависимости от того, что Вас больше интересует. Хотя лучше, начать с постов 1-5, посвящённых основным понятиям. Чтобы Вам было легче ориентироваться в блоге, я сделала этот «навигатор». Все посты разделены на блоки, в рамках которых можно найти материалы по заинтересовавшей теме. По мере выкладывания новых постов их номер будет заноситься в соответствующий блок.
I. Вводная часть (посты 1-5). Здесь рассказывается для кого и о чём мой блог, даётся определение терминам пол, гендер и сексуальная ориентация,  приводятся общие сведения об интерсексуальности, трансгендерности и третьем поле.
II. Интерсексуальность и её генетические причины (посты 6 -15, 21)
В этом блоке рассказывается, как формируется пол эмбриона, описываются конкретные клинические варианты с указанием генов, дефекты в которых их вызывают.
III. Интерсексуалы в женском спорте (посты 16-20) Этот блок о том, как поиски переодетых мужчин среди участниц женских соревнований выявили спортсменок с различными формами интерсексуальности, как менялись правила их допуска к соревнованиям и какие они в настоящее время.
IV. Трансгендеры цивилизаций, допускающих небинарность  (посты 22 -27). Хиджры Индии, муше Мексики, омеггиды Панамы, фа’афафины Самоа, факалейти Тога, уникальная гендерная система народа Бугис.
V. Трансгендеры Запада (посты 28-38). В этом блоке даётся определение терминов трансгендер, транссексуал, гендерная дисфория и др.; рассказывается о медицинском взгляде на проблему и отношении к ней общества; приводятся данные о частоте трансгендеров и причинах её роста; рассматриваются варианты небинарного гендера.
VI. Трансгендерные спортсменки в женском спорте (посты 39-41).
В этом блоке рассказывается о первых трансгендерных спортсменках, правилах МОК и World Athletics, регламентирующих участие трансгендеров в женских соревнованиях, и о спорах в отношении этих правил.
VII. Научные исследования причин трансгендерности (посты 42-55). В этом блоке рассматриваются механизмы полового диморфизма мозга, в частности роль половых гормонов; приводятся данные об особенностях мозга трансгендеров, выявляемых при МРТ; рассказывается о роли генетических факторов и поисках генов связанных с трансгендерностью.
VIII. Нетрадиционная сексуальная ориентация (посты 56-.....)
IX. Научные исследования причин нетрадиционной сексуальной ориентации
(посты .....)


55. Полное секвенирование генома (WGS) трансгендеров

В  этом посте я хочу рассказать о результатах исследования, в котором ДНК трансгендеров впервые изучали с помощью методов секвенирования нового поколения — «Genomic Characteristics of Gender Dysphoria Patients and Identification of Rare Mutations in RYR3 Gene» (https://www.nature.com/articles/s41598-017-08655-x ).
Авторами были учёные из Китая, их статья была опубликована на два года раньше, чем исследование из США, о котором шла речь в посте 54. Почему же я вначале привела американскую работу? Дело в том, что в ней фактически сохранялась логика поиска генов трансгендерности предшествующих исследований – ищем среди тех генов, которые каким-либо образом связаны с половыми гормонами. Об этом рассказывалось в постах 51 и 52 (правда, там использовались не столь «продвинутые» методы генетического анализа). А вот китайские исследователи попытались выйти за эти рамки и найти иной подход. Что же у них получилось? 

Были просеквенированы полные геномы 4 трансгендеров M→F и полные экзомы 9 трансгендеров F→M (WGS и WES, соответсвенно). Все эти трансгендеры относились к основной этнической группе в Китае (Хань) и у всех было раннее начало гендерной дисфории. При секвенировании было выявлено огромное число генетических вариантов, отличных от эталонной ДНК. Все они были подвергнуты фильтрации и в дальнейший анализ включались только те, которые удовлетворяли следующим критериям:

Collapse )

54. Полное секвенирование экзома (WES) трансгендеров

Продолжаю рассказ о поиске генов, ответственных за трансгендерность. Современные методы секвенирования ДНК позволяют «прочесть» экзом (совокупность всех кодирующих участков генома) и даже полный геном. На первый взгляд, кажется, что с их помощью можно легко найти гены, ответственные за тот или иной признак или болезнь. Надо лишь сравнить последовательность ДНК (сиквенс) тех, кто имеет изучаемый признак, с сиквенсом эталонной ДНК (Human reference genome). Однако в реальности всё намного сложней. Основная проблема связана со сложностью поиска в гигантском массиве отличий, выявляемых при секвенировании любого генома, «сигнала», относящегося к изучаемому признаку. В полной мере это относится и к исследованию, о котором пойдёт речь в данном посте — The Use of Whole Exome Sequencing in a Cohort of Transgender Individuals to Identify Rare Genetic Variants. Эта статья исследователей из США опубликована в декабре 2019 года и она доступна здесь: https://www.nature.com/articles/s41598-019-53500-y 

Collapse )

53. Методы полногеномного анализа

Два следующих поста будут посвящены результатам исследования трансгендерности с помощью методов полногеномного анализа. Но для начала стоит ознакомиться с тем, что это такое. Есть три высокотехнологичных подхода, которые используются в поисках генов, ответственных за какой-то признак или болезнь:
· полногеномное исследование ассоциации (Genome Wide Association Study - GWAS)
· полное секвенирование экзома (Whole Exome Sequencing - WES)
· полное секвенирование генома (Whole Genome Sequencing - WGS).

Все три метода пока что довольно дорогие, хотя цена быстро падает. Это ограничивает количество образцов ДНК, которые могут исследовать даже хорошо финансируемые лаборатории.  GWAS, WES и WGS это очень хорошие методы, но не нужно питать иллюзий, что с их помощью можно запросто выявить генетические варианты, ответственные за изучаемый признак. Увы, здесь много «подводных камней». Посмотрим, что же это за методы. 

Collapse )

52. Трансгендерность и гены, кодирующие рецепторы андрогенов и эстрогенов

Для понимания данного поста, желательно ознакомиться с постом 50.

Продолжим рассмотрение возможной связи трансгендерности с полиморфизмом генов, имеющих отношение к половым гормонам. В предыдущем посте рассматривалась ассоциация с аллелями SNP, в этом речь пойдёт о STR. Частоты аллелей и генотипов STR можно рассчитывать точно также как это делалось для SNP. Однако для сравнения трансгендеров с контролем использование этих частот окажется статистически малоинформативным. В отличие от SNP, имеющих два аллеля, у STR их более десятка, а количество генотипов ещё больше. Поэтому для STR есть иной подход. Он основан на использовании медианного значения числа повторов. Проиллюстрирую это на следующем примере. Допустим, генотипирование STR в гене ERβ было проведено у 5 человек; у каждого есть два аллеля, то есть всего 10 аллелей. Расположим все эти 10 аллелей в порядке увеличения размера повтора: 

                               17 · 19 · 20 · 22 · 22│23 · 23 · 25· 27 · 29

Медиана это значение, по отношению к которому половина аллелей имеет меньший размер, а другая половина больший. В нашем случае медиана (показана как│) находится посередине между аллелем 22 и аллелем 23, то есть она равна 22.5. Медианы определяются в группе трансгендеров и в контроле, а затем проводится статистический анализ, который должен показать является ли разница в значениях медиан в сравниваемых группах статистически значимой. 

Collapse )

50. Полиморфные маркеры — инструменты в поиске генов трансгендерности

Изменения в генах могут быть одной из причин трансгендерности. На роль генетики указывают результаты изучения однояйцовых и двуяйцовых близнецов (об этом пост 42). Однако трансгендерность явно не классическое моногенное состояние и метод, позволивший выявить причину многих генетических заболеваний (linkage analysis), здесь неприменим. В настоящее время для поиска генов, вовлечённых в трансгендерность, используют два подхода. Первый основан на изучении ассоциации трансгендерности с полиморфными маркерами, другой на секвенировании. Об этих исследованиях и пойдёт речь в нескольких последующих постах. Но для начала нужно разобраться с некоторыми базовыми понятиями.  Начнём с генетического полиморфизма и расчёта связанных с ним частот.  

Полиморфизм это когда в одном и том же месте генома может быть два или более вариантов последовательности ДНК. Эти варианты называют аллелями, правда полиморфными считаются только те, чья частота выше 1%. Если же частота меньше 1%, то аллель обозначаетмя как редкий. Изучение ассоциации трансгендерности с каким-либо полиморфизмом основано на сравнении частот генотипов или частот аллелей полиморфного сайта в контрольной группе и у трансгендеров. В работах по генетике трансгендерности использовали два типа полиморфных маркеров: 

· SNP (single nucleotide polymorphism)  -  одно-нуклеотидный полиморфизм 

· STR (short tandem repeats)  -  короткие тандемные повторы 

Collapse )

43. Трансгендерность и половой диморфизм мозга

Мозг женщин и мозг мужчин отличаются. Для обозначения этого факта используют термин половой диморфизма мозга, а для механизма его обеспечивающего два других -  феминизация и маскулинизация мозга, то есть формирование мозга в женском или мужском направлении. Вполне резонно предполагать, что сбои в этом механизме могут приводить к трансгендерности -  феминизации мозга плода XY или, наоборот, маскулинизации мозга плода ХХ. Но что известно науке в отношении самого механизма полового диморфизма мозга?

В настоящее время принято считать, что ключевую роль в этом механизме играют половые гормоны и прежде всего высокий уровень тестостерона (мужской половой гормон). Все вроде бы аналогично тому, как формируется пол эмбриона (об этом пост 6 https://eis-gen.livejournal.com/1605.html). У эмбриона XY высокий уровень продуцируемого яичками тестостерона обеспечивает формирование наружных половых органов по мужскому типу. У эмбриона ХХ уровень тестостерона очень низкий и развитие гениталий идёт по женскому пути. Однако в отношении мозга дело одним тестостероном не ограничивается. Более того, выяснилось нечто совершенно неожиданное и даже, на первый взгляд, абсурдное  -  маскулинизация мозга, то есть формирование его мужским, осуществляется женским половым гормоном эстрадиолом. Сразу же возникает, по меньшей мере, два вопроса. 

1) откуда у плода мужского пола эстрадиол?

2) почему эстрадиол маскулинизирует только мозг плода мужского пола, но не оказывает аналогичного воздействия на женский? 

Collapse )

42. Трансгендерность и генетика. Результаты близнецового анализа

Если какой-либо признак обусловлен генетическими факторами, то его частота среди родственников людей, имеющих данный признак, должна быть выше частоты этого признака в популяции. Более того, частота зависит от степени родства с этими людьми – у их родных братьев и сестёр она должна быть выше, чем у двоюродных. На степени генетического родства основан и широко используемый близнецовый метод. Последний, к тому же, позволяет  исключить разницу в воздействии внешних факторов во время внутриутробного развития, к примеру, приём матерью лекарств во время беременности. В отличие от своих братьев и сестёр близнецы в этот период находятся в одинаковых условиях. 

Collapse )

В перерыве между блоками - 3

Я заинтересовалась темой, которой посвящён мой блог, около четверти века назад. Случилось это во время отдыха в Таиланде (Паттайя), когда я с мужем побывала на шоу трансвеститов. Это было очень красочное представление, с великолепными костюмами и декорациями. Все участницы шоу были рождены мальчиками. В Таиланде их называют леди-бой, а по современной западной терминологии это трансгендеры (правда, тогда это название было не столь известно). Меня удивило количество участниц – их было слишком много. К тому же оказалось, что это не единственное подобное шоу в Паттайя. Почему же трансгендеров в Таиланде так много? Ведь ни в России, ни в других странах, где я до этого побывала, их в то время не то что не было видно, но о них не было даже и слышно.  

Collapse )