Tags: ген рецептора эстрогенов

52. Трансгендерность и гены, кодирующие рецепторы андрогенов и эстрогенов

Для понимания данного поста, желательно ознакомиться с постом 50.

Продолжим рассмотрение возможной связи трансгендерности с полиморфизмом генов, имеющих отношение к половым гормонам. В предыдущем посте рассматривалась ассоциация с аллелями SNP, в этом речь пойдёт о STR. Частоты аллелей и генотипов STR можно рассчитывать точно также как это делалось для SNP. Однако для сравнения трансгендеров с контролем использование этих частот окажется статистически малоинформативным. В отличие от SNP, имеющих два аллеля, у STR их более десятка, а количество генотипов ещё больше. Поэтому для STR есть иной подход. Он основан на использовании медианного значения числа повторов. Проиллюстрирую это на следующем примере. Допустим, генотипирование STR в гене ERβ было проведено у 5 человек; у каждого есть два аллеля, то есть всего 10 аллелей. Расположим все эти 10 аллелей в порядке увеличения размера повтора: 

                               17 · 19 · 20 · 22 · 22│23 · 23 · 25· 27 · 29

Медиана это значение, по отношению к которому половина аллелей имеет меньший размер, а другая половина больший. В нашем случае медиана (показана как│) находится посередине между аллелем 22 и аллелем 23, то есть она равна 22.5. Медианы определяются в группе трансгендеров и в контроле, а затем проводится статистический анализ, который должен показать является ли разница в значениях медиан в сравниваемых группах статистически значимой. 

Collapse )